Enligt IPMA kommer den gula varningen att gälla fram till 18.00 på söndag för de flesta av dessa 17 distrikt.
Bragança, Viseu, Évora, Porto, Guarda, Faro, Vila Real, Setúbal, Viana do Castelo, Lissabon, Leiria, Beja, Castelo Branco, Aveiro, Coimbra, Portalegre och Braga kommer att omfattas av en gul varning på grund av nederbörd och från och med i eftermiddag även på grund av grov sjö.
På söndagen placerade IPMA fem distrikt under orange varning på grund av havsvågorna mellan klockan 00.00 på lördag och 09.00 på söndag.
Coimbra, Porto, Aveiro, Braça och Viana do Castelo är de distrikt som har orange varning, vilket indikerar en vädersituation med måttlig risk.
Varningar för översvämningar utfärdade
På grund av det dåliga vädret varnade den nationella myndigheten för räddningstjänst och civilskydd (ANEPC) på fredagen befolkningen för "ogynnsamma vädersituationer" under de kommande dagarna, med kraftiga skurar som kan orsaka översvämningar, måttliga till starka vindar och höga havsvågor.
Baserat på information från det portugisiska institutet för hav och atmosfär (IPMA) varnar räddningstjänsten för "kraftiga och ihållande regn, särskilt i Alto Alentejo och Minho", en situation som kommer att fortsätta i dag, åtföljd av åskväder och med möjlighet till översvämningar i städerna.