IPMA-varningen gäller mellan 06:00 och 18:00 idag, för distrikten Porto, Braga och Viana do Castelo, på grund av prognosen för "regn, ibland starkt och ihållande, och med enstaka åskväder".
Tidigare, mellan 03:00 och 06:00 idag, var samma distrikt under gul varning på grund av "kraftigt och ihållande" regn.
I Aveiro gäller den orange varningen mellan 12:00 och 18:00, medan den gula varningen gäller mellan 09:00 och 12:00.
Även distrikten Viseu, Aveiro och Coimbra omfattas av gul varning idag, mellan 09:00 och 18:00, medan varningen i Vila Real gäller mellan 06:00 och 18:00 och i Leiria mellan 12:00 och 18:00.
Enligt det senaste uttalandet från IPMA är Setúbal, mellan kl. 15.00 och 21.00, och Lissabon, mellan kl. 15.00 och 18.00, också under gul varning idag.
Den gula varningen för dessa distrikt beror på prognosen för "regn, ibland kraftigt och ihållande, och med enstaka åskväder".
Distrikten Porto, Viana do Castelo, Lissabon, Leiria, Aveiro, Coimbra och Braga kommer att vara under gul varning mellan 00:00 och 15:00 på fredag, på grund av prognosen för havsrörelser med "nordvästliga vågor med fyra fem meter."
Den nationella myndigheten för katastrof- och civilskydd(ANEPC) utfärdade på torsdagen en varning till befolkningen för de kommande 24 timmarna, med kraftigt regn i de norra och centrala kustregionerna, vind och snöfall över 1 400 meters höjd.
Varningen baserades på prognoser från det portugisiska institutet för hav och atmosfär (IPMA) som rapporterar "regn, ibland starkt och ihållande, i regionerna i norra och centrala kusten, särskilt i Minho och Douro kusten, utvecklas mot söder och möjligheten till is och frostbildning i norra och centrala inlandet i landet.
IPMA uppskattar också risken för snöfall över 1400 meters höjd, vindförstärkning från den södra kvadranten, med vindbyar på upp till 70 km/timme i den norra kustremsan Cabo Raso och på höglandet och vågor från nordväst med fyra till fem meter på den norra och centrala kusten.
Den orange varningen är den näst allvarligaste på skalan och utfärdas i "meteorologiska situationer med måttlig till hög risk", enligt IPMA.
Den gula varningen utfärdas av IPMA när det finns en risksituation för vissa aktiviteter beroende på vädersituationen.