Brasiliassa syntynyt, mutta portugalilainen Pepe on voittanut koko uransa aikana yli 30 mestaruutta, muun muassa Euroopan mestaruuden maajoukkueen kanssa vuonna 2016 ja kolme Mestarien liigaa, kaikki Real Madridin kanssa.

Puolustaja hyvästelee Portugalin joukkueen 141 ottelulla ja 8 maalilla ja on kaikkien aikojen kolmanneksi eniten maajoukkuepelaajia Portugalin joukkueessa, heti Cristiano Ronaldon (212) ja João Moutinhon (146) jälkeen.