Bragança, Viseu, Porto, Guarda, Vila Real, Viana do Castelo, Castelo Branco och Braga är de distrikt som omfattas av varningen fram till klockan 18.00.
IPMA varnar för "åskväder och regn, som kan ge hagel, tillsammans med kraftiga vindbyar" för dessa områden i landet.
Det väntas skurar och åska i norr och mitten, särskilt i inlandet, med molnig himmel på västkusten fram till sent på morgonen och en sänkning av maximitemperaturen i söder.