"Alla avgångar och ankomster i Frankfurt är för närvarande inställda", medan rörelser "från eller till Münchens flygplats har delvis påverkats", sade koncernen i ett uttalande till AFP.
Datorfelet ledde till att flera flygningar som trafikeras av flygbolagsgruppen Lufthansa , som också äger Austrian Airlines, Swiss och Brussels Airlines, ställdes in.
"Vi har fortfarande ingen uppgift om hur många flygningar som berörs av dessa störningar", sade en talesman för koncernen till AFP.
"I slutet av morgonen kunde vissa flygplan landa, men isolerat".
Viktig information om flygstörningar: Från och med i morse påverkas flygbolagen i Lufthansagruppen av ett IT-avbrott som orsakats av byggnadsarbeten i Frankfurtregionen. Tyvärr har detta lett till förseningar och inställda flygningar. Vi arbetar på --
Lufthansa (@lufthansa) February 15,2023Förstörningen orsakades av "byggnadsarbete i Frankfurtregionen", sade Lufthansa på Twitter och tillade att man letade efter en lösning.
Fyra internetkablar som drivs av Deutsche Telekom "skadades" på tisdagskvällen under arbete på en järnvägslinje, vilket orsakade störningen som påverkade datorsystemet, berättade en talesman för telekomkoncernen för AFP, och förklarade att två kablar redan har reparerats.