Varningarna väntades fram till kl. 18.00 idag och baseras på prognoser från Portugals havs- och atmosfärsinstitut(IPMA) om den allmänna vädersituationen (vind och hav) för skärgårdens kustlinje.
Enligt kaptenen kommer vinden att vara "mycket frisk till stark i syd/sydväst, gradvis bli måttlig till frisk i väst från slutet av morgonen och kommer att bli lugn till måttlig i nord/nordväst från slutet av eftermiddagen".
När det gäller vågorna kommer de att vara cirka två meter i de norra och södra delarna av ön.
Kaptenen insisterar på rekommendationer till hela sjöfartssamhället och befolkningen i allmänhet om de försiktighetsåtgärder som ska vidtas, både när man förbereder sig för att gå till sjöss och när man är till sjöss eller i kustområden.
Förstärkt förtöjning och övervakning av förtöjda och ankrade fartyg, undvikande av promenader nära havet eller i områden som är utsatta för grov sjö, och avstående från fritidsfiske, särskilt nära klippor och klippområden som ofta träffas av brytande vågor, är några av de indikationer som lämnas i meddelandet.
Alla regioner på Madeira omfattas av en gul varning från IPMA på grund av kraftigt regn.
Väderläget påverkar också trafiken på Madeiras internationella flygplats, där ANA - Aeroportos de Portugal på sin officiella sida meddelar att fyra flygningar från Porto, Lissabon och Porto Santo ställs in kl. 10.00 i dag, vilket också påverkar motsvarande avgångar.