Enligt IPMA gäller från och med kl. 12.00 i dag en gul vädervarning för distrikten Bragança, Viseu, Porto, Guarda, Vila Real, Viana do Castelo, Santarém, Castelo Branco, Leiria, Aveiro, Coimbra och Braga.
På fredag gäller den gula varningen för nederbörd och åska även Portalegre, Beja, Évora, Faro, Setúbal och Lissabon.
IPMA varnade för prognoser om en försämring av vädret på Portugals fastland, med ibland kraftig nederbörd, åtföljd av hagel och åskväder.
Enligt prognoserna kommer försämringen av väderförhållandena att fortsätta fram till söndag, på grund av verkan av en depression centrerad väster om den iberiska halvön som kommer att röra sig nordost från lördag, vilket orsakar en progressiv förbättring av tidens tillstånd.
För lördag förväntar sig tekniker redan en betydande försämring av vädret, med nederbörd som fortfarande förekommer, särskilt i norra och centrala regioner, men med mindre intensitet än tidigare dagar, utan nederbörd förväntas från söndag och framåt.
En temperaturnedgång förväntas också fram till lördag, med en gradvis återhämtning från söndag, efter förbättringen av vädret.