In een verklaring van het uitvoerend orgaan van de Gemeenschap staat: "In tegenstelling tot de richtlijn en de jurisprudentie van het Hof van Justitie van de Europese Unie staat de Portugese wetgeving toe dat er niet alleen rekening wordt gehouden met verzachtende maatregelen, maar ook met compenserende maatregelen voor de schade die van het project wordt verwacht, wanneer wordt bepaald of een project significante gevolgen heeft voor Natura 2000-gebieden. Het toestaan van het meenemen van deze compenserende maatregelen tijdens de beoordeling van een project brengt het resultaat van de beoordeling in gevaar."

De Habitatrichtlijn (Richtlijn 92/43/EEG) vereist dat voor plannen en projecten die significante gevolgen kunnen hebben voor een Natura 2000-gebied een passende beoordeling van de gevolgen voor het gebied moet worden gemaakt voordat een vergunning wordt verleend en dat deze plannen en projecten alleen met bepaalde uitzonderingen kunnen worden goedgekeurd als zij de integriteit van het Natura 2000-gebied niet aantasten.

Volgens de richtlijn in kwestie is het een van de belangrijkste instrumenten van Europa om de biodiversiteit te beschermen, wat een belangrijke doelstelling is van de Europese Green Deal en de Biodiversiteitsstrategie voor 2030.

Portugal heeft twee maanden de tijd om te reageren op de kennisgeving van Brussel.